Walaupun kedua-dua MOC dan MOF mengandungi logam-ikatan penyelarasan organik, terdapat perbezaan asas:
Dimensi: MOC ialah molekul diskret 0 dimensi, manakala MOF ialah rangkaian lanjutan tak terhingga 2D atau 3D.
Keterlarutan: Kebanyakan MOC larut, manakala MOF umumnya tidak larut.
Kestabilan: MOF umumnya mempunyai kestabilan haba yang lebih tinggi.
Fokus aplikasi: MOC cemerlang dalam pengecaman molekul, manakala MOF lebih sesuai untuk penyimpanan gas.